Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Prrt1O35449 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Prrt1O35449 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prrt1O35449 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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