Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tnfrsf11aO35305 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf11aO35305 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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