Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smad6O35182 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smad6O35182 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms