Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NumblO08919 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NumblO08919 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NumblO08919 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NumblO08919 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NumblO08919 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NumblO08919 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NumblO08919 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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NumblO08919 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NumblO08919 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NumblO08919 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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NumblO08919 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NumblO08919 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NumblO08919 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NumblO08919 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NumblO08919 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NumblO08919 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NumblO08919 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NumblO08919 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NumblO08919 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NumblO08919 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NumblO08919 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NumblO08919 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NumblO08919 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NumblO08919 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NumblO08919 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NumblO08919 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NumblO08919 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NumblO08919 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NumblO08919 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NumblO08919 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NumblO08919 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NumblO08919 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NumblO08919 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NumblO08919 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NumblO08919 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NumblO08919 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NumblO08919 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NumblO08919 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NumblO08919 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NumblO08919 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NumblO08919 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NumblO08919 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NumblO08919 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NumblO08919 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NumblO08919 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NumblO08919 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NumblO08919 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NumblO08919 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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NumblO08919 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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NumblO08919 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NumblO08919 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NumblO08919 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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NumblO08919 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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NumblO08919 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NumblO08919 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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NumblO08919 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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NumblO08919 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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NumblO08919 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NumblO08919 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NumblO08919 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NumblO08919 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NumblO08919 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NumblO08919 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NumblO08919 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NumblO08919 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NumblO08919 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NumblO08919 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NumblO08919 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NumblO08919 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NumblO08919 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NumblO08919 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NumblO08919 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NumblO08919 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NumblO08919 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NumblO08919 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NumblO08919 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NumblO08919 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NumblO08919 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NumblO08919 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NumblO08919 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NumblO08919 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NumblO08919 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms