Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltaO08585 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltaO08585 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CltaO08585 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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