Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm3239L7N2D9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm3239L7N2D9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm3239L7N2D9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm3239L7N2D9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3239L7N2D9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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