Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20939L7N243 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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