Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm2888K7N746 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm2888K7N746 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm2888K7N746 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm2888K7N746 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm2888K7N746 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm2888K7N746 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm2888K7N746 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms