Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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