Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm5294J3QP53 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm5294J3QP53 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms