Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Gm20795J3QP49 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm20795J3QP49 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm20795J3QP49 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gm20795J3QP49 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm20795J3QP49 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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