Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3415J3QMS8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms