Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lipo1J3QME6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lipo1J3QME6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lipo1J3QME6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lipo1J3QME6 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lipo1J3QME6 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lipo1J3QME6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lipo1J3QME6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms