Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm21818J3KMS6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm21818J3KMS6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm21818J3KMS6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm21818J3KMS6 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Gm21818J3KMS6 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm21818J3KMS6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm21818J3KMS6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm21818J3KMS6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm21818J3KMS6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm21818J3KMS6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm21818J3KMS6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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