Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arfgef1G3X9K3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Arfgef1G3X9K3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms