Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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R3hdm1E9Q9Q2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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R3hdm1E9Q9Q2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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R3hdm1E9Q9Q2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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R3hdm1E9Q9Q2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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R3hdm1E9Q9Q2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
R3hdm1E9Q9Q2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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