Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Urb2E9Q7L1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Urb2E9Q7L1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms