Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Myo5cE9Q1F5 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms