Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vmn1r68E9Q0V3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms