Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm3298E9PW80 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms