Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc175E9PVB3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms