Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms