Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc6D3YZP9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms