Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm4950D3YUM8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm4950D3YUM8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms