Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cttnbp2B9EJA2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms