Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cspp1B2RX88 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms