Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cfap58B2RW38 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap58B2RW38 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms