Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Usf3B2RUQ2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms