Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Brpf1B2RRD7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms