Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Odf2A3KGV1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Odf2A3KGV1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms