Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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Scn3aA2ASI5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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Scn3aA2ASI5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Scn3aA2ASI5 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Scn3aA2ASI5 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scn3aA2ASI5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Scn3aA2ASI5 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Scn3aA2ASI5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Scn3aA2ASI5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Scn3aA2ASI5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Scn3aA2ASI5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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