Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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