Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms