Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Frmpd1A2AKB4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Frmpd1A2AKB4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms