Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdccag3A2AIW0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms