Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc163A2AGD7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms