Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col9a3A2ACT7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col9a3A2ACT7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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