Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc194A0A140LIT1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms