Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms