Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 1700027I24Rik-201ENSMUST00000183612 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm43149-201ENSMUST00000198162 1422 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 AC107757.2-201ENSMUST00000226370 1466 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms