Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm5538W4VSP6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm5538W4VSP6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm5538W4VSP6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm5538W4VSP6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm5538W4VSP6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5538W4VSP6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5538W4VSP6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5538W4VSP6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5538W4VSP6 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5538W4VSP6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5538W4VSP6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5538W4VSP6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5538W4VSP6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5538W4VSP6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gm5538W4VSP6 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5538W4VSP6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5538W4VSP6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5538W4VSP6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5538W4VSP6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5538W4VSP6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5538W4VSP6 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5538W4VSP6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5538W4VSP6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5538W4VSP6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5538W4VSP6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5538W4VSP6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5538W4VSP6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5538W4VSP6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5538W4VSP6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5538W4VSP6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5538W4VSP6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5538W4VSP6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5538W4VSP6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm5538W4VSP6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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