Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm3550W4VSN7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms