Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ap3b1Q9Z1T1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ap3b1Q9Z1T1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms