Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ddx39bQ9Z1N5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms