Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Clip2Q9Z0H8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Clip2Q9Z0H8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Clip2Q9Z0H8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Clip2Q9Z0H8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Clip2Q9Z0H8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Clip2Q9Z0H8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Clip2Q9Z0H8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Clip2Q9Z0H8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clip2Q9Z0H8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clip2Q9Z0H8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms