Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sh3bgrQ9WUZ7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sh3bgrQ9WUZ7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sh3bgrQ9WUZ7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sh3bgrQ9WUZ7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sh3bgrQ9WUZ7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sh3bgrQ9WUZ7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bgrQ9WUZ7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sh3bgrQ9WUZ7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sh3bgrQ9WUZ7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms