Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

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Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcsQ9WU84 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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