Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Psmb3Q9R1P1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms