Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ripk3Q9QZL0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ripk3Q9QZL0 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms