Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ercc4Q9QZD4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms